Benjamin Stora dirige actuellement les thèses suivantes :

L’unité du Maghreb à l’épreuve des indépendances. Par Zineb Tazi-sadeq sous la direction de Benjamin Stora à l’Institut national des langues et civilisations orientales (INALCO).
Le rôle du général Bellounis pendant la guerre d’indépendance algérienne entre FLN et MNA, et son impact dans la région de Djelfa (1954-1962). Par Malika Khobeizi sous la direction de Benjamin Stora. A l’Institut national des langues et civilisations orientales (INALCO).
Naima Moghir :
Lieu d’inscription : INALCO, 2009.
Sujet : Les Juifs du Maroc et les relations israélo marocaines.
Sekri Leila
Lieu d’inscription : INALCO, 2009.
Sujet : Crimes et répression : internement administratif des Tunisiens (1881-1945).
Sonia Ben Hadj Brahim :
Sujet : Mémoire et histoire des Juifs de Tunisie, 1956-2006.
Lieu d’inscription : Paris 13, 2010.
Diane Jeanblanc :
Sujet : La mémoire de l’Empire britannique dans l’Angleterre d’aujourd’hui.
Lieu d’inscription : Paris 13, 2011.
Fatima Besnaci-Lancou :
Sujet : Le CICR et la guerre d’Algérie.
Lieu d’inscription, Paris 13, 2012.
Fathi Bentabet :
Sujet : Le mouvement ouvrier dans l’Oranie, 1919-1939.
Leu d’inscrption et soutenance en 2013 : Paris 13.